ม.1 มีโปรแกรมดังนี้

• แผนการเรียน TahFiz-Science (รับเฉพาะนักเรียนชายที่มีผลการเรียน 5 เทอม 3.00 ขึ้นไป) 1 ห้อง จํานวน 45 คน
• แผนการเรียน SMA (ต้องมีผลการเรียน 5 เทอม 3.00 ขึ้นไป หากเป็นผู้ผ่านการคัดเลือกเข้าศึกษาฌโรงเรียนวิทยาสาสตร์ชั้นนำ จะพิจารณาเป็นพิเศษ) นักเรียนชาย 1 ห้อง จํานวน 40 คน นักเรียนหญิง 2 ห้อง จํานวน 80 คน
• แผนการเรียน SME (หากเป็นนักเรียนที่มีความสามารถในการสื่อสารภาษาอังกฤษจะพิจารณาเป็นพิเศษ ) นักเรียนชาย 1 ห้อง จํานวน 40 คน นักเรียนหญิง 1 ห้อง จํานวน 40 คน
• แผนการเรียน SMC รับสมัครนัดเรียนที่มีความสามารถด้านคมพิวเตอร์ เน้นการเป็นโปรแกรมเมอร์ เปิดรับเฉพาะนักเรียนชาย 1 ห้อง จํานวน 40 คน
• แผนการเรียนทั่วไป จำนวน 17 ห้องเรียน

ม.4 มีโปรแกรมดังนี้

• แผนการเรียน SMP นักเรียนชาย 1 ห้อง จํานวน 30 คน นักเรียนหญิง 1 ห้อง จํานวน 40
  (หมายเหตุ SMP เปิดรับสมัครในช่วงวันที่ 18-28 มกราคม 2564 เท่านั้น)
• แผนการเรียน SMART-ENG หากเป็นผู้ที่เคยได้รับรางวัลทางด้านภาษาอังกฤษในระดับจังหวัดขขึ้นไป จะพิจารณาเป็นพิเศษ โดยเปิดรับนักเรียนชาย 1 ห้อง จํานวน 40 คน นักเรียนหญิง 1 ห้อง จํานวน 40 คน
• แผนการเรียน SMART-ART หากเป็นผู้ที่เคยได้รับรางวัลทางด้านศิลปะในระดับจังหวัดขึ้นไป จะพิจารณาเป็นพิเศษ โดยเปิดนักเรียนชาย 1 ห้อง จํานวน 40 คน นักเรียนหญิง 1 ห้อง จํานวน 40 คน
• แผนการเรียน วิทย์-คณิตทั่วไป จำนวน 17 ห้อง

หมายเหตุ สำหรับนักเรียนชั้นศาสนา จพคะดเข้าห้องเรียนมนช่วงรายงานตัวเท่านั้น เว้นแต่ห้องเรียนแผนการเรียนพิเศษที่ทางโรงเรียนขอวสงวนสิทธิ์ให้เริ่มเรียนชั้นศาสนาชั้น 3 อิบตีดาอีย์ และ ระดับอิสลามศึกษาตอนปลบาย (ชั้น 1 ซานาวีย์) จะมี 2 แผนกาเรียนภาษาสำหรับวิชาศาสนา โดยให้นักเรียนเลือก คือ ภาษาอาหรับ AP และโปรแกรมภาษามลายู (นูซันตารา) NP